48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5431 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  90.37 
 
 		 135 aa  249  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  92.59 
 
 		 135 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  81.48 
 
 		 135 aa  224  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  78.52 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  49.63 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  36.79 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.35 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  34.35 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  34.35 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  36.79 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  32.52 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  32.52 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  33.61 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  32.71 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  32.82 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.92 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.45 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.65 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  30.47 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  28.24 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  29.2 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.84 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.21 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  31.36 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.91 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  28.36 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  33.7 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.03 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  31.19 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  35.82 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.84 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  30.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  25.71 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  32.18 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  27.94 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  32.18 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  32.18 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>