More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2680 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  65.68 
 
 		 481 aa  640    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 476 aa  963    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  94.33 
 
 		 476 aa  895    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  66.17 
 
 		 477 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  71.46 
 
 		 482 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  64.5 
 
 		 476 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  63.92 
 
 		 477 aa  627  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.71 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  65.75 
 
 		 478 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.35 
 
 		 481 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  63.35 
 
 		 481 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 		 481 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  62.29 
 
 		 482 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  63.08 
 
 		 477 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  64.06 
 
 		 479 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  62.45 
 
 		 477 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  63.85 
 
 		 478 aa  616  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  62.24 
 
 		 477 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  62.03 
 
 		 477 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  63.77 
 
 		 481 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 		 481 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  62.77 
 
 		 479 aa  604  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  63.56 
 
 		 481 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.14 
 
 		 481 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.08 
 
 		 481 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  61.68 
 
 		 481 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  59.96 
 
 		 480 aa  593  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  61.89 
 
 		 480 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  60.97 
 
 		 477 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  63.56 
 
 		 478 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.92 
 
 		 478 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  63.42 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.56 
 
 		 478 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  60.59 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  55.39 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.38 
 
 		 475 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.54 
 
 		 477 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  55.16 
 
 		 476 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  52.83 
 
 		 485 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  52.83 
 
 		 495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 		 475 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  50.64 
 
 		 477 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  49.25 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 		 485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  50.42 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.69 
 
 		 477 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.99 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 		 476 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  46.93 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  45.97 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.09 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.64 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  44.82 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.56 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  42.43 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.38 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.37 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.16 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.16 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.61 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.25 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.95 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.37 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.38 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.25 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.28 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.25 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.25 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.04 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.74 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.66 
 
 		 492 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.9 
 
 		 481 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.04 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.52 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.25 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.25 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.28 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.09 
 
 		 483 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.74 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.28 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.76 
 
 		 487 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.09 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.25 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.52 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.81 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>