More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1330 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 294 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  85.71 
 
 		 294 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  66.9 
 
 		 300 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  65.86 
 
 		 299 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  52.31 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.56 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  32.87 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 318 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 727 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 1035 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 374 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.34 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 		 663 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.52 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  41.59 
 
 		 597 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.52 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.29 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 655 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.79 
 
 		 642 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 230 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.91 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 268 aa  99  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 1177 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.55 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.59 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 672 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 573 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 336 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 326 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 353 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 373 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 347 aa  95.5  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 351 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 1177 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 544 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.12 
 
 		 341 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 390 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 344 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 812 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 341 aa  93.2  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 930 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 1032 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  41.07 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 337 aa  92.4  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 326 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 338 aa  92.4  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 342 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>