More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3944 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  100 
 
 		 382 aa  795    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  97.91 
 
 		 382 aa  744    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  98.95 
 
 		 382 aa  788    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  92.67 
 
 		 382 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  74.87 
 
 		 383 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  67.42 
 
 		 378 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  64.8 
 
 		 385 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  64.8 
 
 		 385 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  65.68 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  64.27 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  62.47 
 
 		 386 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  62.22 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  61.45 
 
 		 385 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  44.09 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  41.24 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  38.33 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  41.06 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  36.87 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  38.18 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  37.85 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  35.13 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  37.8 
 
 		 403 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.24 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  36.76 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.69 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.86 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.63 
 
 		 410 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  34.41 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.61 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.88 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  32.54 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  33.43 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  36.15 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  32.63 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  34.91 
 
 		 397 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.64 
 
 		 405 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  33.94 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  32.49 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  32.46 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  32.31 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  31.78 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  32.72 
 
 		 400 aa  163  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  33.02 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.2 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.11 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  31.31 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.51 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.44 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.13 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  33.7 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.13 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.45 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  33.71 
 
 		 394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  32.05 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  31.83 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.71 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  31.12 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  33.24 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  31.12 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  31.12 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  31.12 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.71 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  31 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  30.75 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  31.06 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  31.12 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  31.64 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  32.38 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  31.13 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  32.96 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.46 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  31.7 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  30.65 
 
 		 444 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.97 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  32.34 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.84 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  32.01 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  30.45 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  30.45 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  30.79 
 
 		 427 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  31.2 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  31.7 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.48 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.43 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  29.61 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  28.91 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.62 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.93 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  32.73 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>