More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0075 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  79.22 
 
 
522 aa  777  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  93.47 
 
 
521 aa  897  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  9.1476e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  96.35 
 
 
521 aa  941  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  1.10429e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  100 
 
 
521 aa  1014  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  99.04 
 
 
521 aa  1004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  75.73 
 
 
522 aa  726  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  75.34 
 
 
522 aa  724  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  65.9 
 
 
546 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  59.52 
 
 
517 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  59.53 
 
 
517 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  43.66 
 
 
626 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  44.08 
 
 
577 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  41.62 
 
 
603 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  41.54 
 
 
584 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  40.15 
 
 
620 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  38.11 
 
 
608 aa  357  2e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  40.53 
 
 
603 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  40.99 
 
 
711 aa  328  1e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  1.3918e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  39.78 
 
 
599 aa  322  1e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  38.29 
 
 
730 aa  305  1e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  37.16 
 
 
620 aa  285  1e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  37.43 
 
 
590 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  38.79 
 
 
711 aa  279  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  36.24 
 
 
703 aa  279  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  35.51 
 
 
588 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  37.06 
 
 
729 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  34.01 
 
 
588 aa  264  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  41.13 
 
 
698 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  30.31 
 
 
580 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.9535e-08  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  33.52 
 
 
703 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  36.49 
 
 
584 aa  256  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  39.37 
 
 
601 aa  256  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  31.14 
 
 
573 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.01 
 
 
578 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  31.89 
 
 
588 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.54 
 
 
585 aa  246  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  40.61 
 
 
584 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.01 
 
 
591 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  33.15 
 
 
583 aa  230  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.51 
 
 
574 aa  226  5e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  34.54 
 
 
586 aa  226  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.93 
 
 
558 aa  226  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.89 
 
 
574 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  33.03 
 
 
605 aa  216  6e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  29.25 
 
 
571 aa  215  1e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  32.61 
 
 
592 aa  213  6e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.15 
 
 
590 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  31.55 
 
 
585 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.06 
 
 
572 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  29.42 
 
 
575 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  29.85 
 
 
605 aa  206  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  30.2 
 
 
573 aa  201  4e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.24 
 
 
577 aa  199  8e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  31.78 
 
 
586 aa  198  2e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  31.94 
 
 
545 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  32.56 
 
 
549 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.07 
 
 
579 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.41 
 
 
581 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  28.63 
 
 
583 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  31.66 
 
 
544 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  29.83 
 
 
585 aa  190  6e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  30.86 
 
 
604 aa  190  6e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  31.7 
 
 
632 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  32.48 
 
 
573 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  29.09 
 
 
555 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  29.8 
 
 
563 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  28.34 
 
 
572 aa  185  2e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  29.83 
 
 
585 aa  185  2e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  26.65 
 
 
570 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  31.9 
 
 
564 aa  183  5e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  27.12 
 
 
550 aa  183  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  28.23 
 
 
581 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  29.59 
 
 
585 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  29.59 
 
 
590 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  29.12 
 
 
585 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  1.94119e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  29.12 
 
 
585 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  29.12 
 
 
585 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  29.12 
 
 
585 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  29.83 
 
 
585 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  27.78 
 
 
587 aa  181  3e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  27.36 
 
 
570 aa  181  3e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  27.06 
 
 
569 aa  181  3e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  27.06 
 
 
569 aa  181  3e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  28.21 
 
 
568 aa  180  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  28.13 
 
 
558 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  30.31 
 
 
592 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  26.69 
 
 
545 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  27.03 
 
 
606 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  30.48 
 
 
580 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  28.76 
 
 
574 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  28.76 
 
 
563 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  42.99 
 
 
694 aa  177  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  33.1 
 
 
426 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  29.19 
 
 
576 aa  175  2e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.55 
 
 
584 aa  175  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  30.35 
 
 
588 aa  175  2e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  24.62 
 
 
587 aa  175  2e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  28.97 
 
 
581 aa  174  4e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  33.77 
 
 
571 aa  174  4e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  24.43 
 
 
552 aa  174  4e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>