42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45054 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45054  predicted protein  100 
 
 
429 aa  894    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  28.77 
 
 
298 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
290 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 
299 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
290 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
289 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
289 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  26.82 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  25.55 
 
 
304 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 
293 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2876  putative ferredoxin  43.94 
 
 
80 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.730811  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3494  putative ferredoxin  37.68 
 
 
78 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.317772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1922  putative ferredoxin  38.71 
 
 
77 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.871908  decreased coverage  0.000431531 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 
214 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
200 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  34.93 
 
 
211 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2017  hypothetical protein  36.92 
 
 
86 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
209 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
200 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  40.74 
 
 
216 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0739  putative ferredoxin  36.36 
 
 
77 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  24.69 
 
 
240 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2323  putative ferredoxin  31.82 
 
 
76 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  36.36 
 
 
213 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  40.58 
 
 
62 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  40.58 
 
 
62 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 
334 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  39.02 
 
 
191 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 
206 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 
209 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 
210 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
201 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 
324 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.17 
 
 
211 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  35 
 
 
211 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.32 
 
 
260 aa  43.5  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
231 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.55 
 
 
208 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 
217 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 
324 aa  43.1  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.55 
 
 
218 aa  43.1  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  23.49 
 
 
246 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>