31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2624 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
290 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  71.38 
 
 
290 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  67.24 
 
 
298 aa  441  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  67.82 
 
 
289 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  67.13 
 
 
289 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  67.13 
 
 
289 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  65.4 
 
 
299 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  49.45 
 
 
293 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  39.66 
 
 
304 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  28.11 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45054  predicted protein  25.62 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  26.52 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  23.87 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0739  putative ferredoxin  45.21 
 
 
77 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  29.48 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  29.48 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1922  putative ferredoxin  43.84 
 
 
77 aa  62.4  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.871908  decreased coverage  0.000431531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3494  putative ferredoxin  43.84 
 
 
78 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.317772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  26.17 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2876  putative ferredoxin  43.24 
 
 
80 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.730811  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  34.15 
 
 
187 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
219 aa  52.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0588  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0740  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.439983  hitchhiker  0.00000000106708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2017  hypothetical protein  39.68 
 
 
86 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  34.15 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  22.03 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  24.16 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>