21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2017 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  173  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3494  putative ferredoxin  49.3 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1922  putative ferredoxin  53.73 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.871908  decreased coverage  0.000431531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2876  putative ferredoxin  40.85 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.730811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0739  putative ferredoxin  51.56 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2323  putative ferredoxin  40.62 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 		 293 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 290 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  38.71 
 
 		 304 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.64 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 289 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 290 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 289 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2964  putative ferredoxin  53.49 
 
 		 48 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184852  normal  0.107034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  38.6 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  38.6 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 		 62 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>