87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44480 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44480  predicted protein  100 
 
 		 497 aa  1023    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000641793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.53 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 424 aa  67  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.06 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 400 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  20.45 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  26.77 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.29 
 
 		 530 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  27.01 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  20.31 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  26.77 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  23.35 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  26.56 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 		 530 aa  50.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  25.98 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.61 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  22.14 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  22.61 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  23.51 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.16 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  25.98 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  25.98 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  25.98 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  25.98 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  32 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 569 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  32 
 
 		 411 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  20.33 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20899  predicted protein  21.69 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.67 
 
 		 697 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19586  predicted protein  23.08 
 
 		 694 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  21.25 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  21.25 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  19.67 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  19.67 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  21.25 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  21.25 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  21.25 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  25.95 
 
 		 531 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  24.05 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  25 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.64 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 343 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 		 535 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  21.4 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 406 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.93 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  20.13 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 396 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  24.39 
 
 		 456 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 		 592 aa  43.5  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 		 678 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 405 aa  43.5  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>