143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19761 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  100 
 
 		 702 aa  1461    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  47.62 
 
 		 689 aa  598  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  46.26 
 
 		 677 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  45.06 
 
 		 661 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  43.91 
 
 		 699 aa  551  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 574 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 579 aa  420  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 574 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 581 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 576 aa  391  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 576 aa  378  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 593 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 630 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 586 aa  364  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 589 aa  362  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 585 aa  333  6e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 585 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 583 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 571 aa  309  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  30.47 
 
 		 602 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 497 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 504 aa  209  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 443 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 433 aa  201  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 530 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 530 aa  198  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 459 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 539 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 485 aa  194  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 481 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 466 aa  164  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 456 aa  161  4e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 488 aa  161  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 488 aa  160  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 451 aa  158  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf348  glycyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 451 aa  157  8e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 508 aa  156  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 457 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 460 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 507 aa  154  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 458 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 460 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 462 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  147  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 502 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 489 aa  145  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 467 aa  145  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 467 aa  145  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0030  glycyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 462 aa  144  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 460 aa  144  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 448 aa  144  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 463 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 463 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 463 aa  143  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 471 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 462 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0411  glycyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 460 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 495 aa  141  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 434 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0045  glycyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 466 aa  140  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 490 aa  140  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 462 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 467 aa  140  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 473 aa  139  2e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>