103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0024 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0024  redox-sensing transcriptional repressor Rex  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0422  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.31 
 
 
227 aa  158  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0403  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.7 
 
 
214 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0351476 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1912  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.32 
 
 
210 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0633376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1593  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.2 
 
 
215 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0756  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.98 
 
 
216 aa  142  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  hitchhiker  1.2736e-12 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0352  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.67 
 
 
214 aa  141  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0213465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1103  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.61 
 
 
213 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1657  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.15 
 
 
211 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.043522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1774  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.52 
 
 
216 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1398  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.04 
 
 
221 aa  135  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6731  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.69 
 
 
256 aa  134  1e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02840  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.67 
 
 
290 aa  134  1e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0242  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.66 
 
 
209 aa  130  1e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0237  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.66 
 
 
209 aa  130  1e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00797494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0313  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.66 
 
 
209 aa  131  1e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.45173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0285  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.66 
 
 
209 aa  130  1e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0235  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.66 
 
 
209 aa  130  1e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.62256e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20290  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.89 
 
 
215 aa  130  2e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0425  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.76 
 
 
256 aa  129  2e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.346833  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2068  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.19 
 
 
214 aa  130  2e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0355  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.76 
 
 
256 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5030  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.17 
 
 
209 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00139563  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0294  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.17 
 
 
209 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0249  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.17 
 
 
209 aa  129  4e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000876436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0263  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.17 
 
 
209 aa  129  4e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0289  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.17 
 
 
209 aa  129  4e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2702  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.68 
 
 
213 aa  128  5e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1645  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.01 
 
 
210 aa  128  8e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.301525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0224  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.68 
 
 
215 aa  128  8e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5695  CoA-binding domain-containing protein  36.73 
 
 
229 aa  127  1e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298917  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2083  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33 
 
 
211 aa  127  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.59118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2120  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33 
 
 
211 aa  127  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00014689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0248  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.68 
 
 
209 aa  127  2e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2734  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.68 
 
 
230 aa  127  2e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1390  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.18 
 
 
215 aa  126  2e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4356  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.5 
 
 
210 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.18319e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1392  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.87 
 
 
220 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2793  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.18 
 
 
214 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02100  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.66 
 
 
217 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4373  CoA-binding domain protein  35.71 
 
 
231 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1603  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.85 
 
 
210 aa  121  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4103  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.24 
 
 
220 aa  121  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0561  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.11 
 
 
208 aa  121  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  2.11824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2257  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.18 
 
 
213 aa  121  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0919  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.36 
 
 
252 aa  120  1e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0547  redox-sensing transcriptional repressor REX  35.71 
 
 
235 aa  120  1e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1468  redox-sensing transcriptional repressor Rex  30.3 
 
 
214 aa  120  1e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1260  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35 
 
 
215 aa  120  2e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262472  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4441  CoA-binding domain protein  37.19 
 
 
273 aa  120  2e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1040  CoA-binding domain protein  36.17 
 
 
226 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0489  redox-sensing transcriptional repressor Rex  31.58 
 
 
209 aa  119  5e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0496  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.18 
 
 
224 aa  117  1e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6132  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.67 
 
 
310 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1308  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.5 
 
 
220 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.727677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1100  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.04 
 
 
210 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0239  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.67 
 
 
290 aa  115  7e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2551  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.5 
 
 
210 aa  115  7e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0343  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.33 
 
 
211 aa  114  1e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2738  CoA-binding domain protein  34.31 
 
 
231 aa  114  1e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.0962881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8327  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.67 
 
 
279 aa  114  1e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670988  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1863  redox-sensing transcriptional repressor Rex  30.93 
 
 
219 aa  113  2e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.488203  normal  0.0196422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0260  CoA-binding domain-containing protein  34.67 
 
 
242 aa  113  2e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02990  redox-sensing transcriptional repressor Rex  31.63 
 
 
214 aa  113  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2288  redox-sensing transcriptional repressor Rex  27.23 
 
 
212 aa  113  2e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.307621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0157  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.33 
 
 
212 aa  113  2e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.496465  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2085  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.67 
 
 
217 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.80446e-07  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0440  CoA-binding domain protein  35.52 
 
 
216 aa  112  4e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0423  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33 
 
 
211 aa  111  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2586  redox-sensing transcriptional repressor Rex  26.18 
 
 
212 aa  110  1e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0129291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4581  CoA-binding domain protein  34.01 
 
 
221 aa  110  1e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0534  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.5 
 
 
215 aa  110  2e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1798  redox-sensing transcriptional repressor Rex  28.02 
 
 
217 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1219  CoA-binding domain protein  33.99 
 
 
209 aa  108  7e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  6.1208e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3096  redox-sensing transcriptional repressor Rex  31.98 
 
 
234 aa  108  7e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0224  redox-sensing transcriptional repressor Rex  29.32 
 
 
227 aa  108  8e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0654  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.85 
 
 
217 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.27046e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0493  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.18 
 
 
225 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2882  redox-sensing transcriptional repressor Rex  29.95 
 
 
212 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1428  redox-sensing transcriptional repressor Rex  28.99 
 
 
219 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0484  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.3 
 
 
380 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0779  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.32 
 
 
208 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07160  AT-rich DNA-binding protein  31.98 
 
 
233 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1501  CoA-binding domain protein  33.85 
 
 
213 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1636  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.68 
 
 
222 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1209  redox-sensing transcriptional repressor Rex  31.64 
 
 
209 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0616  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.2 
 
 
260 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0515217  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0394  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  104  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000948355  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1156  redox-sensing transcriptional repressor Rex  30.15 
 
 
216 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0756  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.32 
 
 
208 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3297  redox-sensing transcriptional repressor Rex  30.46 
 
 
231 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1585  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.5 
 
 
214 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0413652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0901  redox-sensing transcriptional repressor Rex  28.02 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3182  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.26 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  4.64351e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4427  redox-sensing transcriptional repressor Rex  29.08 
 
 
219 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00746984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1366  redox-sensing transcriptional repressor Rex  30.2 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1396  CoA-binding domain protein  25.79 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87659e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0630  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.1 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.529498  normal  0.840606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1320  redox-sensing transcriptional repressor Rex  29.85 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0469886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2902  CoA-binding domain protein  29.67 
 
 
219 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586678  normal  0.272447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>