103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0901 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0901  redox-sensing transcriptional repressor Rex  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2586  redox-sensing transcriptional repressor Rex  63 
 
 
212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0129291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2288  redox-sensing transcriptional repressor Rex  62.5 
 
 
212 aa  264  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.307621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0496  redox-sensing transcriptional repressor Rex  65.24 
 
 
224 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1798  redox-sensing transcriptional repressor Rex  61.72 
 
 
217 aa  242  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2882  redox-sensing transcriptional repressor Rex  59.51 
 
 
212 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02100  redox-sensing transcriptional repressor Rex  50.48 
 
 
217 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1468  redox-sensing transcriptional repressor Rex  47.87 
 
 
214 aa  207  7e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0654  redox-sensing transcriptional repressor Rex  55.45 
 
 
217 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4356  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.44 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0779  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.87 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20290  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.08 
 
 
215 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.252712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6731  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.25 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1863  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.15 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.488203  normal  0.0196422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1645  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.5 
 
 
210 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.301525  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0756  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.39 
 
 
208 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4103  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.33 
 
 
220 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1040  CoA-binding domain protein  38.35 
 
 
226 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2734  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
230 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1392  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.33 
 
 
220 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4373  CoA-binding domain protein  38.73 
 
 
231 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2551  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.98 
 
 
210 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0547  redox-sensing transcriptional repressor REX  38.61 
 
 
235 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0534  redox-sensing transcriptional repressor Rex  44.5 
 
 
215 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02840  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.12 
 
 
290 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0260  CoA-binding domain-containing protein  37.62 
 
 
242 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0616  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.82 
 
 
260 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0515217  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0343  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.23 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0493  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.81 
 
 
225 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1209  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.18 
 
 
209 aa  154  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8327  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.42 
 
 
279 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670988  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0630  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.85 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.529498  normal  0.840606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1390  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4427  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.35 
 
 
219 aa  151  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00746984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1603  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.29 
 
 
210 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1501  CoA-binding domain protein  40.87 
 
 
213 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0157  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.3 
 
 
212 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.496465  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02990  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.69 
 
 
214 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0394  CoA-binding domain-containing protein  40.38 
 
 
213 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000948355  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2702  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41 
 
 
213 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2068  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41 
 
 
214 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5695  CoA-binding domain-containing protein  37.31 
 
 
229 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298917  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4441  CoA-binding domain protein  39.6 
 
 
273 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0239  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.81 
 
 
290 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0425  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.14 
 
 
256 aa  148  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.346833  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0355  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.69 
 
 
256 aa  147  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3096  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.92 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1774  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.9 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3297  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.45 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1103  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.8 
 
 
213 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1260  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.81 
 
 
215 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262472  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2738  CoA-binding domain protein  34.45 
 
 
231 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.0962881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1636  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.89 
 
 
222 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07160  AT-rich DNA-binding protein  35.89 
 
 
233 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0403  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.06 
 
 
214 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0351476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0423  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39 
 
 
211 aa  143  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0919  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.92 
 
 
252 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2793  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.92 
 
 
214 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1308  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.75 
 
 
220 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.727677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2257  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.31 
 
 
213 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0352  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.62 
 
 
214 aa  141  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0213465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0489  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.82 
 
 
209 aa  141  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0285  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.83 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0235  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.83 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0242  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.83 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0313  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.83 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000245173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0294  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.83 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5030  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.83 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00139563  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0224  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.02 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2085  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000180446  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0237  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.35 
 
 
209 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00797494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0249  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.35 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000876436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0263  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.35 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0289  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.35 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1156  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.62 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0248  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.32 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6132  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.69 
 
 
310 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0440  CoA-binding domain protein  37.93 
 
 
216 aa  138  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0561  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39 
 
 
208 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000211824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0484  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.19 
 
 
380 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1398  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.24 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0374  CoA-binding domain protein  39.11 
 
 
222 aa  131  6.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4581  CoA-binding domain protein  34.85 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1585  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.22 
 
 
214 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0413652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0422  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.61 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2902  CoA-binding domain protein  36.04 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586678  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1657  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.84 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.043522  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2083  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.15 
 
 
211 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000159118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2120  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.15 
 
 
211 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00014689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0224  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.63 
 
 
227 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1428  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.49 
 
 
219 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1100  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.5 
 
 
210 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3182  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.63 
 
 
216 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000464351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1219  CoA-binding domain protein  32.68 
 
 
209 aa  121  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000061208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1912  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.9 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0633376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0756  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.78 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  hitchhiker  0.0000000000012736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1177  Rex DNA-binding domain protein  34.76 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00139347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1396  CoA-binding domain protein  31.4 
 
 
220 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000587659  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0024  redox-sensing transcriptional repressor Rex  28.02 
 
 
218 aa  105  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1320  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.57 
 
 
203 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0469886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>