40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2442 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1102    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  99.27 
 
 
546 aa  1093    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  34.76 
 
 
532 aa  270  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  33.14 
 
 
546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  32.21 
 
 
526 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  34.89 
 
 
517 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  33.59 
 
 
533 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  31.46 
 
 
535 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  33.4 
 
 
533 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  32.41 
 
 
528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  33.71 
 
 
547 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  32.21 
 
 
528 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  28.13 
 
 
543 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  27.78 
 
 
592 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  27.78 
 
 
592 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  28.77 
 
 
557 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  27.34 
 
 
569 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  30 
 
 
531 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.86 
 
 
536 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  24.89 
 
 
618 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  28.93 
 
 
531 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  25.93 
 
 
605 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  25.52 
 
 
658 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  25.36 
 
 
607 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  28.1 
 
 
618 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  29.19 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  24.77 
 
 
516 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  24.77 
 
 
516 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
513 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  29.45 
 
 
516 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  24.77 
 
 
516 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  24.77 
 
 
516 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  26.79 
 
 
558 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  31.33 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  29.46 
 
 
588 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.35 
 
 
729 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  31.51 
 
 
529 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  28.21 
 
 
593 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  29.09 
 
 
492 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>