More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4822 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  100 
 
 
173 aa  357  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2099  Rhodanese domain protein  36.55 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0523024  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1575  rhodanese domain-containing protein  34.35 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00593854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1444  Rhodanese domain protein  33.08 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000128878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42 
 
 
383 aa  81.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05030  hypothetical protein  37.66 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1901  Rhodanese domain protein  30.87 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.63 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.28 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.28 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  26.87 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.37 
 
 
392 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.55 
 
 
390 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.14 
 
 
387 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
117 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 
113 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  29.06 
 
 
144 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  37.89 
 
 
105 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.37 
 
 
393 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.14 
 
 
390 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.56 
 
 
138 aa  61.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  37.25 
 
 
107 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 
375 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  32.71 
 
 
377 aa  60.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
149 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
111 aa  60.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
346 aa  60.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35.29 
 
 
142 aa  60.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
149 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  30.97 
 
 
140 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
149 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
106 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  36.14 
 
 
390 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32 
 
 
379 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.46 
 
 
388 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  30.43 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  36.27 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.34 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  34.26 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  27.61 
 
 
343 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  31.31 
 
 
355 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  41.46 
 
 
116 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  30 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
116 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  31.31 
 
 
339 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  31.31 
 
 
355 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
107 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
111 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.07 
 
 
395 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.73 
 
 
392 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  27.4 
 
 
269 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  34.74 
 
 
349 aa  58.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.73 
 
 
398 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  32 
 
 
356 aa  58.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  38.1 
 
 
389 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 
353 aa  58.2  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.96 
 
 
478 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.73 
 
 
396 aa  58.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
113 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  32.38 
 
 
355 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  31.3 
 
 
123 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.21 
 
 
480 aa  58.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
144 aa  57.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  28.24 
 
 
137 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  32.08 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  32.08 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  35.79 
 
 
350 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.97 
 
 
123 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  35.29 
 
 
107 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
109 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  35.29 
 
 
107 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>