36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4493 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  47.89 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  42.96 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  42.96 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  45.99 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  45.32 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  41.43 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  44.59 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  40.28 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.41 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  36.24 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  40.32 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  31.69 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  30.88 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  30.61 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  32.41 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  32.19 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  29.87 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  32 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  33.07 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  30.23 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  26.14 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  24.24 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  26.03 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  40.62 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  40 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>