More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4439 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
730 aa  1477  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.21 
 
 
695 aa  626  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.92 
 
 
663 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  81.89 
 
 
650 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  81.62 
 
 
648 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  56.59 
 
 
650 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  57.72 
 
 
652 aa  571  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  55.14 
 
 
604 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  50.2 
 
 
565 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  46.53 
 
 
565 aa  479  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  63.79 
 
 
614 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  63.51 
 
 
625 aa  462  1e-128  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  50.6 
 
 
578 aa  453  1e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  42.43 
 
 
584 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  41.42 
 
 
586 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  40.88 
 
 
579 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  42.72 
 
 
595 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.72 
 
 
452 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.86 
 
 
561 aa  327  4e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.89 
 
 
547 aa  327  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0431  Hedgehog/intein hint domain protein  73.16 
 
 
1232 aa  327  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.940006  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  47.79 
 
 
429 aa  326  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.86 
 
 
559 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.09 
 
 
589 aa  314  3e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.28 
 
 
562 aa  314  4e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.27385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.71 
 
 
562 aa  313  5e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.71 
 
 
562 aa  313  6e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.96 
 
 
582 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.16 
 
 
562 aa  310  7e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  40.05 
 
 
579 aa  310  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.16 
 
 
562 aa  309  1e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.16 
 
 
562 aa  309  1e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.16 
 
 
562 aa  308  2e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.48 
 
 
547 aa  307  5e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.88 
 
 
562 aa  307  5e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 
547 aa  307  5e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.16 
 
 
562 aa  306  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.88 
 
 
562 aa  306  9e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.15 
 
 
522 aa  305  1e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.02 
 
 
462 aa  306  1e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.25 
 
 
551 aa  305  2e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.61 
 
 
562 aa  305  2e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.06 
 
 
562 aa  303  8e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  43.21 
 
 
548 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.98 
 
 
579 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.63 
 
 
735 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.92 
 
 
611 aa  298  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.43 
 
 
567 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.9 
 
 
588 aa  294  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.7 
 
 
582 aa  294  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  43.53 
 
 
582 aa  293  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.06 
 
 
586 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.94 
 
 
395 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  44.33 
 
 
568 aa  292  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.83 
 
 
550 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.06 
 
 
632 aa  291  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.37 
 
 
565 aa  291  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.37 
 
 
565 aa  291  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.09 
 
 
527 aa  290  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.45 
 
 
755 aa  290  8e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.32 
 
 
613 aa  290  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.04981e-05  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.43 
 
 
579 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41 
 
 
569 aa  289  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.75 
 
 
682 aa  288  3e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.23 
 
 
518 aa  288  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.32 
 
 
606 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  35.77 
 
 
559 aa  286  8e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.66 
 
 
570 aa  285  3e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.6 
 
 
602 aa  285  3e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.5 
 
 
540 aa  284  4e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.68 
 
 
601 aa  284  4e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.68 
 
 
601 aa  284  4e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  42.06 
 
 
900 aa  284  5e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  42.25 
 
 
807 aa  283  7e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.29 
 
 
614 aa  283  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.45 
 
 
584 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.96 
 
 
554 aa  282  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.2733e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  50.18 
 
 
562 aa  281  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.77 
 
 
589 aa  281  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.38 
 
 
649 aa  281  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.95 
 
 
723 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.49 
 
 
610 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.36 
 
 
599 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.28 
 
 
582 aa  280  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.63 
 
 
447 aa  279  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  3.24435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.9 
 
 
520 aa  279  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.95 
 
 
614 aa  279  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.05 
 
 
1071 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.69 
 
 
608 aa  279  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.35 
 
 
606 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.41 
 
 
575 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.16 
 
 
1040 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  38.62 
 
 
602 aa  278  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.05 
 
 
1045 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.24 
 
 
613 aa  277  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.22 
 
 
1113 aa  277  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.44 
 
 
732 aa  277  6e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.42 
 
 
518 aa  276  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.39 
 
 
911 aa  276  1e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  3.97841e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.05 
 
 
948 aa  276  1e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.66847e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>