More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3897 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  83.11 
 
 		 450 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  83.56 
 
 		 450 aa  767    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  83.33 
 
 		 450 aa  765    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  86.53 
 
 		 450 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  83.07 
 
 		 447 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  92.01 
 
 		 470 aa  831    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  83.33 
 
 		 450 aa  766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  83.33 
 
 		 450 aa  765    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  84.25 
 
 		 448 aa  775    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  86.53 
 
 		 450 aa  792    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  83.33 
 
 		 450 aa  765    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  86.53 
 
 		 450 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  84.56 
 
 		 447 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  83.11 
 
 		 450 aa  764    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  91.05 
 
 		 452 aa  833    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  84.56 
 
 		 447 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  85.49 
 
 		 459 aa  783    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  98.01 
 
 		 453 aa  910    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  83.33 
 
 		 450 aa  765    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  84.56 
 
 		 447 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  100 
 
 		 453 aa  924    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  84.56 
 
 		 447 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  50.46 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  47.56 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  49.42 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  48.72 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  43.74 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  43.68 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  44.34 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  43.51 
 
 		 436 aa  359  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  42.17 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  42.76 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  43.19 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  42.76 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  42.53 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  42.2 
 
 		 438 aa  352  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  42.43 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  42.2 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  42.5 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  42.46 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  42.14 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  40.91 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  38.8 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  40.49 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  31.85 
 
 		 523 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  34.62 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  34.09 
 
 		 437 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  31.13 
 
 		 522 aa  202  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  31.8 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  31.8 
 
 		 439 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  33.41 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.34 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  36.56 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  37.21 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.86 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 437 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  34.32 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  31.99 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  33.18 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  35.12 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  32.29 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  32.54 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  32.54 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  32.54 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  32.54 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 437 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  32.24 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  32.24 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  32.24 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>