36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1310    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  67.13 
 
 
652 aa  852    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  67.13 
 
 
648 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  97.32 
 
 
652 aa  1212    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  66.46 
 
 
651 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  66.36 
 
 
648 aa  854    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  69.63 
 
 
651 aa  823    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  69.12 
 
 
653 aa  887    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  66.67 
 
 
664 aa  824    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  69.16 
 
 
653 aa  902    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  68.4 
 
 
653 aa  889    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  46.44 
 
 
623 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  46.44 
 
 
623 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  45.41 
 
 
598 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  26.92 
 
 
625 aa  62.4  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  30.07 
 
 
620 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  27.01 
 
 
622 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  29.33 
 
 
617 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  25 
 
 
617 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  25 
 
 
617 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  25.62 
 
 
668 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  26.04 
 
 
617 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  28.67 
 
 
617 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  28.67 
 
 
620 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  27.45 
 
 
617 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  25.31 
 
 
665 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  28.67 
 
 
617 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  26.22 
 
 
618 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  26.04 
 
 
618 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  25.15 
 
 
664 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  27.22 
 
 
648 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  30.15 
 
 
619 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  24.68 
 
 
670 aa  47  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  24.38 
 
 
629 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  24.44 
 
 
630 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  23.56 
 
 
631 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>