More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  98.38 
 
 		 494 aa  1000    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  64.02 
 
 		 494 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  63.82 
 
 		 494 aa  665    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  83.2 
 
 		 495 aa  844    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  67.07 
 
 		 501 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  100 
 
 		 494 aa  1016    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  68.16 
 
 		 493 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  62.73 
 
 		 500 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  62.65 
 
 		 507 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  61.34 
 
 		 497 aa  621  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  62.53 
 
 		 529 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  61.13 
 
 		 519 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  60.94 
 
 		 500 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  60.53 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  61.13 
 
 		 519 aa  614  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  59.76 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  61.43 
 
 		 496 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  61.63 
 
 		 495 aa  611  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  60.61 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  59.71 
 
 		 494 aa  607  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  60.04 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  61.63 
 
 		 497 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  57.58 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  57.37 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  60.69 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  61.55 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  60.98 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  60.94 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  58.87 
 
 		 497 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  59.27 
 
 		 497 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.59 
 
 		 498 aa  592  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  61.3 
 
 		 495 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  58.06 
 
 		 497 aa  591  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  56.56 
 
 		 496 aa  588  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.56 
 
 		 496 aa  588  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  56.8 
 
 		 513 aa  585  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  58.15 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  57.03 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.51 
 
 		 497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  58.23 
 
 		 500 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  57.93 
 
 		 498 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  57.52 
 
 		 498 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  56.59 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  56.59 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  56.59 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  57.76 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  55.1 
 
 		 498 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  56.59 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  58.42 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  56.59 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  55.1 
 
 		 498 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  56.59 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  56.59 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  57.96 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  54.9 
 
 		 499 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  55.38 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  56.19 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  57.52 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  55.58 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  54.05 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.85 
 
 		 496 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.85 
 
 		 496 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  55.38 
 
 		 500 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.85 
 
 		 496 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  56.33 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  55.38 
 
 		 500 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  55.17 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  55.38 
 
 		 500 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.71 
 
 		 501 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  54.05 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  53.64 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.85 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  56.35 
 
 		 502 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  53.64 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.85 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  55.8 
 
 		 498 aa  567  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  55.17 
 
 		 500 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  56.53 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.64 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  59.22 
 
 		 501 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  58.11 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  57.26 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  54.58 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  56.94 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.36 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  54.93 
 
 		 507 aa  559  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  57.49 
 
 		 499 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  54.58 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  54.38 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1485  glycerol kinase  52.75 
 
 		 505 aa  557  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00136931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  55.33 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  56.76 
 
 		 507 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  58.85 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>