34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_17510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1520  hypothetical protein  97.01 
 
 		 335 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17510  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.58 
 
 		 470 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.58 
 
 		 471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.26 
 
 		 470 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  41.03 
 
 		 475 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  43 
 
 		 487 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43 
 
 		 487 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.27 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  42.77 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.89 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.89 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.06 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  28.66 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  26.22 
 
 		 436 aa  49.3  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.38 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.4 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.95 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  29.45 
 
 		 197 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.26 
 
 		 1042 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.45 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3857  WD40 domain protein beta Propeller  27.35 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  27.21 
 
 		 450 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  24.27 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.21 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.42 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  25 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.22 
 
 		 683 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.26 
 
 		 1040 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.92 
 
 		 686 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1042 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  23.91 
 
 		 427 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  27.42 
 
 		 175 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>