200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0390 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 294 aa  586  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  29.62 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  24.2 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.33 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  29.51 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  27.68 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  26.53 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  27.24 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  24.01 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  28.38 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  27.45 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  24.03 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  23.49 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  26.65 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  25.33 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  25.97 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  26.33 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  27.3 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  25.65 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  29.03 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  26.58 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  27.45 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  26.47 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  27.45 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.08 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  24.62 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  26.23 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  25.9 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  22.11 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  26.47 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  24.13 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  25.99 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  25.97 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  23.96 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  23.49 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  25.33 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  27.18 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  26.6 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.16 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  24.33 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  23.49 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  24.33 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  27.21 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  26.22 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  33.52 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  24.43 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  29.49 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  23.51 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  23.67 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  29.44 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  21.97 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  23.33 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  24.52 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  24.76 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  24.39 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  29.01 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  24.69 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  28.77 
 
 		 870 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  25 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  23.84 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  25.24 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  23.08 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  23.84 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.8 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  25.96 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  23.84 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  23.84 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  23.84 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  24.53 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  28.57 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  23.91 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.26 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.53 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  29.81 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  24.21 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  24.16 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  24.21 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  27.22 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  26.58 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.21 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  23.29 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  27.72 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  26.79 
 
 		 420 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  30.1 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  27.78 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  28.5 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  22.33 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 		 524 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  26.58 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  29.31 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  29.31 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  32.35 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>