17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0094 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  41.11 
 
 
298 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  37.37 
 
 
291 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  37.69 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  34.66 
 
 
269 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  34.9 
 
 
329 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  33.21 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  35.67 
 
 
304 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  31.15 
 
 
287 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  24.49 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  23.69 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  26.83 
 
 
224 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  24.73 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  23.33 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  22.61 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  20.5 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  38.89 
 
 
451 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>