43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28588 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009373  OSTLU_28588  predicted protein  100 
 
 		 125 aa  259  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  50 
 
 		 778 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  47.83 
 
 		 776 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  47.83 
 
 		 784 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 403 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.89 
 
 		 469 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  44.19 
 
 		 792 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02874  conserved hypothetical protein  44.23 
 
 		 1365 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.46357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  48.72 
 
 		 941 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.15 
 
 		 821 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  37.5 
 
 		 551 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  43.4 
 
 		 593 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  56.25 
 
 		 787 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.9 
 
 		 818 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  33.77 
 
 		 375 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.59 
 
 		 1919 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  47.5 
 
 		 1312 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  44.44 
 
 		 1147 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.44 
 
 		 553 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  52.94 
 
 		 692 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  44.68 
 
 		 714 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.35 
 
 		 837 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.48 
 
 		 570 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.75 
 
 		 554 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  43.75 
 
 		 560 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.9 
 
 		 1679 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  51.43 
 
 		 817 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  47.5 
 
 		 911 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 2082 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  40.48 
 
 		 569 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  43.59 
 
 		 553 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  55.17 
 
 		 328 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10609  mitochondrial protein Fmp25, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11100)  36.84 
 
 		 575 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.730659  normal  0.181462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.04 
 
 		 1848 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  37.5 
 
 		 577 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  37.84 
 
 		 375 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  39.29 
 
 		 544 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.94 
 
 		 563 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  51.52 
 
 		 326 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  46.51 
 
 		 737 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02073  BTB domain and ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04760)  40 
 
 		 1680 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.768919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  35.94 
 
 		 477 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>