More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2917 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  100 
 
 
321 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
316 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
316 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
316 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
316 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
316 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
316 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
327 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  81.88 
 
 
316 aa  540  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  81.56 
 
 
316 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  73.21 
 
 
319 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  73.21 
 
 
319 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  73.21 
 
 
319 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  73.21 
 
 
319 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  80 
 
 
329 aa  474  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  80.34 
 
 
329 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  67.96 
 
 
463 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  68.37 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  68.58 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  68.37 
 
 
330 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  68.58 
 
 
330 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  68.58 
 
 
330 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  68.07 
 
 
348 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  68.07 
 
 
355 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  63.21 
 
 
320 aa  425  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  69.53 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  59.5 
 
 
316 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  59.5 
 
 
316 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  76.45 
 
 
286 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  76.45 
 
 
329 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  59.19 
 
 
316 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  59.19 
 
 
316 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  59.19 
 
 
316 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  59.19 
 
 
316 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  56.74 
 
 
321 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  57.01 
 
 
320 aa  375  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  59.27 
 
 
314 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  57.74 
 
 
314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  73.71 
 
 
303 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  58.36 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  57.99 
 
 
265 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  72.91 
 
 
221 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  71.57 
 
 
206 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  83.23 
 
 
188 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  58.12 
 
 
259 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  77.85 
 
 
153 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  68.48 
 
 
178 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  55.26 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  70.59 
 
 
170 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  81.82 
 
 
111 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  37.15 
 
 
333 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  38.59 
 
 
321 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  38.59 
 
 
321 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  38.59 
 
 
463 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  37.85 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  38.96 
 
 
323 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  48.04 
 
 
216 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  37.97 
 
 
325 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  37.97 
 
 
325 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  35.78 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  37.34 
 
 
323 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  37.34 
 
 
323 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  32.93 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  30.75 
 
 
323 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  32.92 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  34.42 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  34.42 
 
 
325 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  33.99 
 
 
497 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  32.92 
 
 
327 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  32.62 
 
 
325 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  34.42 
 
 
329 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  35.19 
 
 
325 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  34.87 
 
 
332 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  34.87 
 
 
343 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  33.91 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  28.79 
 
 
330 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  52.63 
 
 
185 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  71.43 
 
 
83 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  75.36 
 
 
83 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  59.22 
 
 
128 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  34.1 
 
 
238 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  37.56 
 
 
216 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  37.56 
 
 
216 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  33.04 
 
 
229 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  77.97 
 
 
197 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  41.41 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  41.22 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  39.39 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  40.59 
 
 
179 aa  95.9  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  40.46 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  41.09 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  41.09 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  39.84 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  40.31 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  28.98 
 
 
338 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  36.43 
 
 
284 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  38.28 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  38.28 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  38.28 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  38.28 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>