204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0061 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  328  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  93.71 
 
 
164 aa  303  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  56.29 
 
 
181 aa  187  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  51.3 
 
 
190 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  53.69 
 
 
189 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  55.7 
 
 
178 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  51.35 
 
 
188 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  56.72 
 
 
187 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.72 
 
 
187 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  32.89 
 
 
186 aa  75.1  4e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0103  hypothetical protein  34.29 
 
 
156 aa  70.5  1e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  30.26 
 
 
188 aa  68.6  4e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  66.6  1e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  29.56 
 
 
197 aa  66.2  2e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  29.87 
 
 
498 aa  65.5  3e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  28.93 
 
 
197 aa  64.3  7e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  27.52 
 
 
189 aa  63.5  1e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  31.91 
 
 
193 aa  63.5  1e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  26.21 
 
 
173 aa  62  3e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  26.21 
 
 
173 aa  62  3e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  26.21 
 
 
173 aa  62  4e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.18727e-14 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.21 
 
 
173 aa  61.6  4e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 
193 aa  61.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  29.22 
 
 
193 aa  61.6  5e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  25.52 
 
 
173 aa  60.8  7e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  29.77 
 
 
193 aa  60.5  8e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  29.77 
 
 
193 aa  60.5  8e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 
184 aa  60.5  8e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  25.52 
 
 
173 aa  60.1  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.21 
 
 
173 aa  60.1  1e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  24.14 
 
 
173 aa  59.7  2e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.14 
 
 
173 aa  59.7  2e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  34.71 
 
 
195 aa  59.7  2e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.71 
 
 
195 aa  59.7  2e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  26.32 
 
 
164 aa  58.9  2e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.14 
 
 
173 aa  59.7  2e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  27.88 
 
 
201 aa  58.2  4e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  27.88 
 
 
194 aa  58.2  5e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 
171 aa  57.4  8e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  31.82 
 
 
174 aa  57  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 
184 aa  57  1e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
195 aa  55.8  2e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  28.86 
 
 
187 aa  55.8  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  32.35 
 
 
167 aa  55.1  4e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2173  Redoxin domain protein  28.95 
 
 
336 aa  54.7  6e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  30.95 
 
 
180 aa  54.3  7e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.81 
 
 
193 aa  54.3  7e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1960  hypothetical protein  29.66 
 
 
163 aa  54.3  7e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.69 
 
 
160 aa  53.9  8e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  25.78 
 
 
469 aa  53.1  1e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  22.82 
 
 
188 aa  52.8  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  25.36 
 
 
165 aa  52.8  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  25.36 
 
 
156 aa  52.8  2e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  25.36 
 
 
165 aa  52.8  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.29 
 
 
596 aa  52.4  3e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0338  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 
180 aa  52.4  3e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
612 aa  52.4  3e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.86 
 
 
173 aa  52  3e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.65 
 
 
221 aa  51.6  4e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
288 aa  51.2  5e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.43 
 
 
422 aa  50.8  7e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 
200 aa  51.2  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.14 
 
 
166 aa  50.8  8e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.77693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  30.34 
 
 
674 aa  50.8  9e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  30 
 
 
188 aa  50.8  9e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  21.99 
 
 
173 aa  50.1  1e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  31.03 
 
 
644 aa  50.4  1e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  29.6 
 
 
169 aa  50.4  1e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.59 
 
 
437 aa  50.4  1e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  28.07 
 
 
172 aa  50.1  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  29.66 
 
 
672 aa  50.1  1e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  28.06 
 
 
592 aa  50.4  1e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  27.33 
 
 
183 aa  50.4  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  27.94 
 
 
695 aa  49.3  2e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.37 
 
 
639 aa  49.7  2e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  28.07 
 
 
165 aa  49.7  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.35 
 
 
182 aa  49.7  2e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 
504 aa  49.7  2e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
493 aa  49.3  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.56 
 
 
280 aa  49.7  2e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.06 
 
 
168 aa  48.9  3e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.9 
 
 
623 aa  48.9  3e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  31.9 
 
 
176 aa  48.9  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
179 aa  48.9  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  3.56135e-06 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.08 
 
 
622 aa  48.5  4e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.08 
 
 
625 aa  48.5  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  27.01 
 
 
172 aa  48.5  4e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  30.23 
 
 
192 aa  48.5  4e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.03 
 
 
699 aa  48.5  4e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  25.42 
 
 
184 aa  48.1  5e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  28.86 
 
 
190 aa  48.1  5e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  31.21 
 
 
697 aa  48.1  5e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  25.53 
 
 
160 aa  47.8  6e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.89 
 
 
634 aa  48.1  6e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.51 
 
 
195 aa  47.8  6e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.64008e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.32 
 
 
189 aa  47.8  7e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  27.01 
 
 
165 aa  47.4  8e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.07 
 
 
455 aa  47.4  8e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  26.52 
 
 
171 aa  47.4  9e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.13 
 
 
589 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>