66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0658 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
379 aa  780    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  37.92 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  33.57 
 
 
388 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.72 
 
 
386 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.59 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  25.17 
 
 
403 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.07 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.24 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.44 
 
 
1074 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.89 
 
 
1034 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.56 
 
 
1034 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.43 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.43 
 
 
628 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.55 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.05 
 
 
428 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.68 
 
 
568 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.41 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.68 
 
 
557 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.35 
 
 
558 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.01 
 
 
632 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.19 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.89 
 
 
889 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.08 
 
 
1061 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.61 
 
 
824 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.42 
 
 
553 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  26.42 
 
 
815 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  23.01 
 
 
586 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.63 
 
 
440 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  23.53 
 
 
606 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.76 
 
 
563 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  28.48 
 
 
429 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  22.78 
 
 
502 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  27.86 
 
 
256 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  27.86 
 
 
256 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.01 
 
 
563 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  30.65 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  26.32 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  25 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.8 
 
 
559 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.09 
 
 
497 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.1 
 
 
557 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.48 
 
 
561 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  22.12 
 
 
821 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.3 
 
 
361 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1977  hypothetical protein  23.9 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.23 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  36.23 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  39.13 
 
 
243 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  31 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  34.78 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
242 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  34.78 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  25.51 
 
 
452 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.09 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.03 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  23 
 
 
879 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  34.78 
 
 
242 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  34.78 
 
 
242 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  36.23 
 
 
249 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  34.78 
 
 
242 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>