44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1661 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  67.89 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  65.45 
 
 		 277 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.74 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  62.04 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  61.82 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.09 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.45 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  61.11 
 
 		 111 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  63.21 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  63.21 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  57.55 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  63.21 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.8 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  62.96 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  55.05 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  53.21 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  55.66 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  51.89 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  51.65 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  49.04 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  48.39 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  45.54 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  40.22 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  47.95 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  42.03 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.888659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  31.08 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  30.67 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 110 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 112 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 112 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>