54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0604 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0604  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  100 
 
 		 391 aa  790    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0588  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  61.89 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4004  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.71 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0099  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  27.04 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2342  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.16 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1810  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.66 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0233725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2362  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.76 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0806  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  25.48 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0765  ABC-type sugar-binding periplasmic protein  22.46 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0679  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  26.52 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4516  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.31 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3345  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.61 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2711  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.38 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1855  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.71 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5039  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.96 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3931  hypothetical protein  24.33 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5185  putative signal peptide protein  23.94 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.0737238 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.71 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02363  signal peptide protein  23.15 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0272231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0587  hypothetical protein  33.91 
 
 		 97 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1595  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.37 
 
 		 368 aa  53.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.32236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3690  hypothetical protein  23.17 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.74 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3887  hypothetical protein  23.17 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  25.52 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0419  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.6 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1480  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.78 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6223  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.5 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.53 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6409  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.91 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000000237151  normal  0.403501 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1988  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.96 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188386  hitchhiker  0.000242477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1986  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.96 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277686  normal  0.0546729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4340  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.76 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0381  Monosaccharide-transporting ATPase  28.03 
 
 		 339 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2147  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.65 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0159332  normal  0.228113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2073  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.96 
 
 		 313 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.269264  hitchhiker  0.00000246592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1399  rhizopine-binding protein precursor  23.83 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000528006  normal  0.827429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3830  hypothetical protein  23.26 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.985949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  24.3 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4067  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.59 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0151386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2028  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.04 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.27 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3975  D-ribose transporter subunit RbsB  24.89 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0740173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4235  D-ribose transporter subunit RbsB  25.2 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000930744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4525  D-ribose transporter subunit RbsB  25.2 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00203677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  24 
 
 		 296 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1599  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.64 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078071  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2406  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.04 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362363  normal  0.524454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2801  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.61 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.64 
 
 		 311 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4172  D-ribose transporter subunit RbsB  24.46 
 
 		 296 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000287299  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1574  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  40.74 
 
 		 329 aa  43.1  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1630  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  40.74 
 
 		 329 aa  43.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  23.26 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>