153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2000 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  33.14 
 
 		 135 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  32.77 
 
 		 137 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  34.48 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  47.89 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  46.48 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2118  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343097  normal  0.41454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  46.48 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  31.18 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  47.89 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  44 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  38.27 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  43.9 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  43.84 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  46.48 
 
 		 100 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2181  cytochrome c family protein  37.65 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  40 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  38.27 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  42.68 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  37.04 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  39.77 
 
 		 300 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  40.45 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  36.71 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  42.11 
 
 		 135 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  43.66 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  42.03 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  39.24 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  40 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  40.79 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 101 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  41.67 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  41.67 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  47.22 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03815  cytochrome C5  40.24 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  28.14 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2303  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0200  cytochrome c class I  28.8 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.657824  normal  0.710005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  38.67 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  41.33 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  41.33 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  38.96 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  30.65 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  37.66 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  41.33 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  37.8 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110389  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  36.71 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  41.33 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  40.79 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  40.79 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  43.66 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  40.58 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  39.24 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  39.24 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  32.89 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  32.18 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  41.33 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>