209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0494 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  64.71 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 136 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  60.58 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  66.39 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  62.88 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  71.05 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  64 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  86.05 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  64.06 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  86.05 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  57.66 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  87.8 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  67.29 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  81.61 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  80.23 
 
 		 136 aa  146  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  85.71 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  80 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  77.38 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  66.07 
 
 		 118 aa  139  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  58.68 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  79.52 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  58.68 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  73.56 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  63.96 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  73.56 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  73.56 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  73.26 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 		 173 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  73.26 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  73.26 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  73.26 
 
 		 118 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  67.37 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  68.29 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  68.29 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  67.86 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  67.86 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  50.46 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  44.14 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1864  MerR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 201 aa  80.5  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0288491  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  54.69 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  47.37 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 196 aa  76.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  42.27 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 757 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  41.24 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  54.55 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>