More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0832 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  841    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  62.17 
 
 
422 aa  513  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  39.95 
 
 
420 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  37.47 
 
 
429 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.02 
 
 
421 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  36.02 
 
 
421 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  36.14 
 
 
477 aa  252  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  39.09 
 
 
426 aa  249  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  34.62 
 
 
467 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  37.08 
 
 
425 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.7 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
470 aa  242  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  36.25 
 
 
420 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  36.62 
 
 
422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  34.42 
 
 
429 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 
468 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  36.98 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  32.47 
 
 
433 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  36.24 
 
 
424 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  33.17 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  32.92 
 
 
424 aa  226  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  34.69 
 
 
425 aa  226  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  35.73 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  30.75 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  34.61 
 
 
418 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  30.5 
 
 
442 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  31.6 
 
 
422 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
438 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  31.69 
 
 
447 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.73 
 
 
448 aa  216  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  36.24 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  31.74 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.73 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  31.54 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  33.5 
 
 
443 aa  212  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.48 
 
 
432 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  29.48 
 
 
442 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  30.37 
 
 
456 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 
434 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  35.06 
 
 
446 aa  209  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
427 aa  208  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  31.5 
 
 
435 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  32.86 
 
 
442 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  30.45 
 
 
443 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 
444 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  32.22 
 
 
438 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  30.12 
 
 
440 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  36.62 
 
 
464 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  30.36 
 
 
436 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  30.77 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  30.12 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  30.11 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  36.62 
 
 
464 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  31.75 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  29.9 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  31.41 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  31.41 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  32.84 
 
 
423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  36.31 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  30.9 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  30.68 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  29.75 
 
 
433 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  30.12 
 
 
436 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  29.85 
 
 
429 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  31.19 
 
 
445 aa  195  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 
434 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  29.67 
 
 
434 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  30.63 
 
 
461 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  30.96 
 
 
464 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  29.71 
 
 
431 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  30.83 
 
 
429 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  30.58 
 
 
445 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  31.08 
 
 
431 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  30.35 
 
 
435 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  30.58 
 
 
424 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  30.35 
 
 
435 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  30.62 
 
 
424 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  31.25 
 
 
424 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  31.25 
 
 
424 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  28.61 
 
 
429 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  31.18 
 
 
427 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  31.25 
 
 
424 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  31.17 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  30.22 
 
 
428 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  29.75 
 
 
441 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  31 
 
 
424 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  31.95 
 
 
429 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  31.25 
 
 
426 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  31.76 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  27.09 
 
 
413 aa  189  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  27.09 
 
 
413 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  27.36 
 
 
420 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  28.33 
 
 
427 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  34.52 
 
 
454 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  31.11 
 
 
428 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  27.36 
 
 
420 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  27.36 
 
 
420 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  27.36 
 
 
420 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  26.83 
 
 
413 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>