More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0541 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  40.35 
 
 
820 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 
784 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 
784 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  37.34 
 
 
821 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 
784 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  39.91 
 
 
784 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  39.91 
 
 
784 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 
784 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  38.03 
 
 
818 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 
784 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  40.08 
 
 
828 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 
784 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 
784 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  39.47 
 
 
841 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  39.41 
 
 
784 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  37.89 
 
 
835 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  39.04 
 
 
816 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  37.77 
 
 
836 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  38.6 
 
 
835 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  38.16 
 
 
830 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.34 
 
 
836 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  37.77 
 
 
836 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  37.77 
 
 
835 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  37.18 
 
 
835 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.05 
 
 
836 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  40.34 
 
 
712 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  38.66 
 
 
810 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  38.72 
 
 
785 aa  174  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 
832 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 
832 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
827 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 
348 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
830 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
842 aa  171  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  36.8 
 
 
828 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
840 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  37.44 
 
 
348 aa  169  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.71 
 
 
842 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  35.5 
 
 
361 aa  167  9e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  39.01 
 
 
341 aa  168  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 
238 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
361 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  38.57 
 
 
341 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.44 
 
 
842 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 
818 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  35.06 
 
 
361 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
841 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  39.06 
 
 
820 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
348 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
776 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.21 
 
 
343 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
843 aa  161  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
238 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  34.63 
 
 
832 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.33 
 
 
837 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  34.05 
 
 
238 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  39.06 
 
 
349 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  34.22 
 
 
476 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  34.51 
 
 
240 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
834 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  36.24 
 
 
842 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
347 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  34.07 
 
 
827 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  34.47 
 
 
833 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
229 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  32.9 
 
 
843 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  35.53 
 
 
399 aa  154  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
381 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.44 
 
 
389 aa  154  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
833 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  36.61 
 
 
345 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  33.48 
 
 
359 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 
351 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  34.21 
 
 
392 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
388 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.07 
 
 
828 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
370 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
347 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  32.9 
 
 
237 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 
365 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 
854 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
828 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 
366 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  30.74 
 
 
370 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
392 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
346 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
392 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
392 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  37.56 
 
 
389 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
361 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  32.33 
 
 
363 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
388 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
388 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
367 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.2 
 
 
392 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  32.76 
 
 
359 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  32.81 
 
 
388 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  34.09 
 
 
352 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
355 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>