More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1929 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.63 
 
 
657 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.46 
 
 
667 aa  813    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.49 
 
 
665 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  53.13 
 
 
684 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
680 aa  1396    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.19 
 
 
660 aa  691    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.62 
 
 
666 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  56.71 
 
 
884 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  54.46 
 
 
885 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  54.46 
 
 
885 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  56.9 
 
 
447 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  53.38 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  52.25 
 
 
428 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  51.76 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  50.47 
 
 
455 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  50.45 
 
 
448 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  49.77 
 
 
455 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  49.65 
 
 
436 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  48.84 
 
 
453 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  49.18 
 
 
447 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  47.66 
 
 
682 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  49.64 
 
 
452 aa  363  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  46.5 
 
 
669 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  49.03 
 
 
442 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  48.95 
 
 
448 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  45.12 
 
 
457 aa  351  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  47.54 
 
 
668 aa  350  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  49.02 
 
 
440 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  47.3 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  47.46 
 
 
428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  47.46 
 
 
428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  43.65 
 
 
681 aa  317  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  46.12 
 
 
681 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  42.69 
 
 
418 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  42.69 
 
 
418 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  38.94 
 
 
445 aa  302  1e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  43.69 
 
 
679 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  43.69 
 
 
679 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  43.94 
 
 
845 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  44.1 
 
 
681 aa  297  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  42.21 
 
 
432 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  41.58 
 
 
427 aa  287  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  41.23 
 
 
443 aa  285  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0447  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  64.84 
 
 
245 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522116  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0380  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  62.98 
 
 
240 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  39.28 
 
 
432 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.36 
 
 
225 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  61.54 
 
 
219 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.91 
 
 
219 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.91 
 
 
219 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.05 
 
 
247 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.46 
 
 
217 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.38 
 
 
218 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.27 
 
 
217 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  51.63 
 
 
216 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4285  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.3 
 
 
217 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2355  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.03 
 
 
220 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.71 
 
 
223 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.05 
 
 
221 aa  210  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.66 
 
 
394 aa  210  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1354  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  51.07 
 
 
245 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2892  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.22 
 
 
219 aa  207  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.640231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  34.96 
 
 
401 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.16 
 
 
216 aa  206  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.7 
 
 
214 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.3 
 
 
306 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  normal  0.299077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  50.7 
 
 
244 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.47 
 
 
236 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.6 
 
 
213 aa  201  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.3 
 
 
217 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0761  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.9 
 
 
462 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.74 
 
 
219 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
220 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.42 
 
 
218 aa  198  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0936  hypothetical protein  42.05 
 
 
462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4629  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.45 
 
 
216 aa  197  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0802433  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.96 
 
 
233 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4262  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.45 
 
 
228 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0258  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.86 
 
 
217 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0773  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.2 
 
 
462 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.07 
 
 
215 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.57 
 
 
224 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.5 
 
 
206 aa  191  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.96 
 
 
213 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000833235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
213 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000601423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4779  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.98 
 
 
212 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565845  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0151  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.72 
 
 
236 aa  187  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51 
 
 
206 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2850  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.17 
 
 
216 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
219 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.57 
 
 
232 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1928  L-isoaspartyl protein carboxyl methyltransferase (protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)  44.23 
 
 
221 aa  183  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.731042  normal  0.421823 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.17 
 
 
215 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2225  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.29 
 
 
220 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.22 
 
 
223 aa  180  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.21 
 
 
215 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4917  fusion protein  52.72 
 
 
205 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1551  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.63 
 
 
218 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1922  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.34 
 
 
220 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1313  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.53 
 
 
197 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000117774  decreased coverage  0.000182851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>