72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3231 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  944    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  96.92 
 
 		 455 aa  916    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  65.42 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  63.04 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  59.59 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  58.85 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  60 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  56.88 
 
 		 885 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  56.88 
 
 		 885 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.4 
 
 		 666 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  53.92 
 
 		 436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  55.09 
 
 		 884 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.89 
 
 		 665 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  52.71 
 
 		 684 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.06 
 
 		 660 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.67 
 
 		 657 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.72 
 
 		 667 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.47 
 
 		 680 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  44.71 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  45.09 
 
 		 448 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  45.95 
 
 		 682 aa  333  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  46.1 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  46.49 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  43.68 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  43.3 
 
 		 681 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  42.39 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  42.61 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  41.56 
 
 		 669 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  45.06 
 
 		 679 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  45.06 
 
 		 679 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  45.06 
 
 		 845 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  44.39 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  42.12 
 
 		 668 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  42.35 
 
 		 681 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  42.09 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  42.09 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  42.66 
 
 		 681 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  41 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  36.24 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  41.36 
 
 		 427 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  39.49 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  39.47 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  38.75 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  37.08 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  33.1 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0761  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  39.37 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0936  hypothetical protein  38.68 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0773  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  38.33 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4917  fusion protein  50.55 
 
 		 205 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2028  succinoglycan biosynthesis protein  22.38 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3289  erythromycin esterase, putative  23.19 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1888  Erythromycin esterase  25.28 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0493647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2994  erythromycin esterase  23.27 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3226  succinoglycan biosynthesis protein  23.12 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0937  hypothetical protein  40.46 
 
 		 216 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5446  Erythromycin esterase  27.54 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2382  hypothetical protein  24.02 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3682  Erythromycin esterase  26.1 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192437  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2055  hypothetical protein  23.42 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2297  hypothetical protein  23.42 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2117  hypothetical protein  23.66 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3148  hypothetical protein  24.01 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.402784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2052  hypothetical protein  22.26 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1817  erythromycin esterase  23.91 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2712  Erythromycin esterase  25.85 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187447  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2112  Erythromycin esterase  25.37 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1168  Erythromycin esterase  24.61 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2296  erythromycin esterase  26.64 
 
 		 526 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0892  erythromycin esterase  22.78 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1949  Erythromycin esterase  28.7 
 
 		 417 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372413  hitchhiker  0.00455868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0278  Erythromycin esterase  19.63 
 
 		 407 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0440  erythromycin esterase  26.65 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>