58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1949 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1949  Erythromycin esterase  100 
 
 
417 aa  829    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372413  hitchhiker  0.00455868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5057  Erythromycin esterase like protein  55.61 
 
 
396 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.641423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0440  erythromycin esterase  49.87 
 
 
391 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6177  Erythromycin esterase  38.68 
 
 
385 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2296  erythromycin esterase  39.95 
 
 
526 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2420  erythromycin esterase  40.15 
 
 
537 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3498  Erythromycin esterase  39.19 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1168  Erythromycin esterase  39.41 
 
 
390 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2112  Erythromycin esterase  39.59 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1817  erythromycin esterase  35.61 
 
 
440 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5446  Erythromycin esterase  38.78 
 
 
449 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1888  Erythromycin esterase  26.39 
 
 
430 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0493647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  27.55 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3289  erythromycin esterase, putative  19.15 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  26.21 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3226  succinoglycan biosynthesis protein  19.16 
 
 
445 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.01 
 
 
660 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  31.13 
 
 
885 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  31.13 
 
 
885 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  23.62 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  23.62 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  33.33 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2994  erythromycin esterase  18.69 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2028  succinoglycan biosynthesis protein  18.88 
 
 
445 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  33.64 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  32.04 
 
 
684 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  25.5 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  30.48 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  28.7 
 
 
455 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  32.56 
 
 
436 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  32.38 
 
 
462 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  30.97 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2055  hypothetical protein  25.74 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  31.78 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  25.89 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2052  hypothetical protein  25.74 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2117  hypothetical protein  25.74 
 
 
345 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.62 
 
 
666 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  30.19 
 
 
682 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2297  hypothetical protein  25.74 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  27.2 
 
 
680 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  29.23 
 
 
681 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2382  hypothetical protein  25.74 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3148  hypothetical protein  19.88 
 
 
443 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.402784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3682  Erythromycin esterase  28.15 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192437  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4732  Erythromycin esterase  31.31 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  30.84 
 
 
679 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  30.84 
 
 
679 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  30.84 
 
 
845 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  28.3 
 
 
884 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  32.69 
 
 
668 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  23.3 
 
 
667 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  27.93 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  32.41 
 
 
669 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  26.55 
 
 
657 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0892  erythromycin esterase  18.9 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30 
 
 
665 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  29.63 
 
 
681 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>