74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4518 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  100 
 
 
428 aa  870    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  100 
 
 
428 aa  870    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  69.58 
 
 
434 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  65.41 
 
 
440 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  61.74 
 
 
442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  51.56 
 
 
448 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  50.6 
 
 
682 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  51.56 
 
 
448 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  50.95 
 
 
669 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  50.84 
 
 
452 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  50.59 
 
 
668 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  48.53 
 
 
681 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  53.63 
 
 
679 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  53.63 
 
 
679 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  53.63 
 
 
845 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  47.15 
 
 
457 aa  352  8e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  50.36 
 
 
681 aa  346  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.46 
 
 
680 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  50.86 
 
 
681 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
660 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.5 
 
 
667 aa  322  9.000000000000001e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.34 
 
 
665 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.37 
 
 
657 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.69 
 
 
666 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  45.66 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  43.36 
 
 
684 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  45.36 
 
 
885 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  45.36 
 
 
885 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0936  hypothetical protein  54.33 
 
 
462 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  46.15 
 
 
884 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  43.03 
 
 
453 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0761  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54 
 
 
462 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  42.08 
 
 
445 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  41.71 
 
 
455 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  42.09 
 
 
455 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0773  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.33 
 
 
462 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  45.55 
 
 
447 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  43.88 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  41.79 
 
 
462 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  41.61 
 
 
436 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  42.3 
 
 
418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  38.33 
 
 
445 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  41.77 
 
 
432 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  40.38 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  41.95 
 
 
418 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  38.61 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  38.22 
 
 
432 aa  202  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  33.65 
 
 
401 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0937  hypothetical protein  60.48 
 
 
216 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4917  fusion protein  48.41 
 
 
205 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3226  succinoglycan biosynthesis protein  25.49 
 
 
445 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2994  erythromycin esterase  25.18 
 
 
447 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2028  succinoglycan biosynthesis protein  23.88 
 
 
445 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3289  erythromycin esterase, putative  23.73 
 
 
441 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1888  Erythromycin esterase  27.83 
 
 
430 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0493647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3682  Erythromycin esterase  35.76 
 
 
436 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192437  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2382  hypothetical protein  21.34 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3148  hypothetical protein  22.1 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.402784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2055  hypothetical protein  22.98 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2297  hypothetical protein  22.98 
 
 
443 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2052  hypothetical protein  21.87 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5446  Erythromycin esterase  25.12 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2117  hypothetical protein  23.3 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581222  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2296  erythromycin esterase  26.9 
 
 
526 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0892  erythromycin esterase  22.8 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2420  erythromycin esterase  28.47 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1168  Erythromycin esterase  31.43 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0440  erythromycin esterase  26.15 
 
 
391 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2112  Erythromycin esterase  25.69 
 
 
445 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1817  erythromycin esterase  25.64 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1949  Erythromycin esterase  23.62 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372413  hitchhiker  0.00455868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2712  Erythromycin esterase  23.2 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187447  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6177  Erythromycin esterase  23.15 
 
 
385 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4732  Erythromycin esterase  29.41 
 
 
313 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>