72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2464 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  96.92 
 
 
455 aa  916    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  100 
 
 
455 aa  941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  65.19 
 
 
428 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  63.29 
 
 
447 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  60.27 
 
 
447 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  59.77 
 
 
445 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  57.58 
 
 
885 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  57.58 
 
 
885 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  59.76 
 
 
462 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.86 
 
 
666 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  54.61 
 
 
436 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  55.09 
 
 
884 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  53.18 
 
 
684 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.06 
 
 
660 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.67 
 
 
657 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.42 
 
 
665 aa  435  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.95 
 
 
667 aa  418  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.77 
 
 
680 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  44.71 
 
 
453 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  44.97 
 
 
448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  46.19 
 
 
682 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  44.92 
 
 
448 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  45.52 
 
 
452 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  43.44 
 
 
457 aa  316  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  43.2 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  43.33 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  44.34 
 
 
681 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  41 
 
 
669 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  45.21 
 
 
679 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  45.21 
 
 
679 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  44.98 
 
 
845 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  41.71 
 
 
428 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  44.39 
 
 
440 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  41.75 
 
 
668 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  41.71 
 
 
428 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  42.35 
 
 
681 aa  292  9e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  43.52 
 
 
681 aa  289  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  41.45 
 
 
427 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  36.49 
 
 
445 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  40.37 
 
 
432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  38.43 
 
 
418 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  39.28 
 
 
443 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  38.52 
 
 
418 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  37.22 
 
 
432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  33.82 
 
 
401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0761  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  39.72 
 
 
462 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0936  hypothetical protein  39.02 
 
 
462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0773  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  38.68 
 
 
462 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4917  fusion protein  50 
 
 
205 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2028  succinoglycan biosynthesis protein  22.61 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0937  hypothetical protein  41.98 
 
 
216 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3289  erythromycin esterase, putative  23.57 
 
 
441 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3226  succinoglycan biosynthesis protein  23.15 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1888  Erythromycin esterase  26.07 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0493647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2994  erythromycin esterase  23.89 
 
 
447 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5446  Erythromycin esterase  26.68 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3682  Erythromycin esterase  27.35 
 
 
436 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192437  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2382  hypothetical protein  22.58 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2055  hypothetical protein  22.82 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2297  hypothetical protein  22.82 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3148  hypothetical protein  23.71 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.402784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2052  hypothetical protein  21.66 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2117  hypothetical protein  23.03 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2712  Erythromycin esterase  26.15 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187447  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1817  erythromycin esterase  23.62 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2112  Erythromycin esterase  25.95 
 
 
445 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1168  Erythromycin esterase  24.92 
 
 
390 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2296  erythromycin esterase  25.72 
 
 
526 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0892  erythromycin esterase  22.7 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1949  Erythromycin esterase  28.7 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372413  hitchhiker  0.00455868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0440  erythromycin esterase  26.95 
 
 
391 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0278  Erythromycin esterase  20.11 
 
 
407 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>