70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3856 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  100 
 
 
427 aa  858    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  57.95 
 
 
432 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  57.52 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  57.82 
 
 
418 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  57.57 
 
 
418 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  49.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  51.08 
 
 
432 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  46.59 
 
 
448 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  43.31 
 
 
682 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  42.92 
 
 
448 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  43.5 
 
 
669 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  42.58 
 
 
452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  44.39 
 
 
885 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  44.39 
 
 
885 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  43.1 
 
 
668 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40.2 
 
 
657 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  44.79 
 
 
401 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40.83 
 
 
667 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.83 
 
 
680 aa  293  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  44.28 
 
 
447 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  43.55 
 
 
884 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  39.9 
 
 
453 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40.19 
 
 
660 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  42.58 
 
 
681 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  42.34 
 
 
681 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.67 
 
 
666 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  43.52 
 
 
447 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40.8 
 
 
665 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  40.15 
 
 
457 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  42.54 
 
 
428 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  43.37 
 
 
679 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  43.37 
 
 
679 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  41.45 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  41.36 
 
 
455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  42.82 
 
 
845 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  43.96 
 
 
681 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  41.09 
 
 
445 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  40.79 
 
 
462 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  40.38 
 
 
428 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  40.38 
 
 
428 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  40.38 
 
 
442 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  40.82 
 
 
436 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  39.85 
 
 
440 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  37.71 
 
 
684 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  37.68 
 
 
434 aa  239  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0761  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  38.6 
 
 
462 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0936  hypothetical protein  38.6 
 
 
462 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0773  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  38.25 
 
 
462 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3226  succinoglycan biosynthesis protein  23.89 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3289  erythromycin esterase, putative  22.06 
 
 
441 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2994  erythromycin esterase  24.04 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2028  succinoglycan biosynthesis protein  22.74 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3682  Erythromycin esterase  27.67 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192437  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4917  fusion protein  38.79 
 
 
205 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3148  hypothetical protein  23.38 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.402784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2382  hypothetical protein  22.67 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1888  Erythromycin esterase  27.52 
 
 
430 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0493647 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2052  hypothetical protein  21.67 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2055  hypothetical protein  21.67 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2297  hypothetical protein  21.67 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2117  hypothetical protein  21.14 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5446  Erythromycin esterase  27.27 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1817  erythromycin esterase  34.07 
 
 
440 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1168  Erythromycin esterase  35.51 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2712  Erythromycin esterase  26.04 
 
 
410 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187447  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0892  erythromycin esterase  21.6 
 
 
405 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1781  Erythromycin esterase  24.37 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5893  erythromycin esterase  26.62 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4732  Erythromycin esterase  32.14 
 
 
313 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>