72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1970 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  100 
 
 
448 aa  914    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  59.13 
 
 
668 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  55.36 
 
 
448 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  56.75 
 
 
669 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  54.92 
 
 
682 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  56.75 
 
 
452 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  53.24 
 
 
681 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  52.87 
 
 
681 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  55.61 
 
 
681 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  53.18 
 
 
679 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  53.18 
 
 
679 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  50.93 
 
 
440 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  53.18 
 
 
845 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  51.56 
 
 
428 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  51.56 
 
 
428 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.45 
 
 
665 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  50 
 
 
885 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  50 
 
 
885 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  47.76 
 
 
457 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  48.84 
 
 
434 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  50 
 
 
884 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.86 
 
 
660 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  49.76 
 
 
447 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.56 
 
 
666 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  47.19 
 
 
445 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.87 
 
 
667 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  48.51 
 
 
442 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.31 
 
 
657 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.95 
 
 
680 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  45.17 
 
 
453 aa  344  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  46.98 
 
 
684 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  48.93 
 
 
447 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  49.17 
 
 
436 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  48.6 
 
 
428 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  46.1 
 
 
455 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  44.92 
 
 
455 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  39.64 
 
 
445 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  44.39 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  42.92 
 
 
427 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  43.12 
 
 
418 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  42.67 
 
 
462 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  41.1 
 
 
443 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  44.16 
 
 
432 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  41.19 
 
 
432 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0936  hypothetical protein  40.46 
 
 
462 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0761  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40.13 
 
 
462 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0773  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  39.47 
 
 
462 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  36.45 
 
 
401 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4917  fusion protein  50.58 
 
 
205 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0937  hypothetical protein  48.59 
 
 
216 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2028  succinoglycan biosynthesis protein  24.16 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3226  succinoglycan biosynthesis protein  24.21 
 
 
445 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3289  erythromycin esterase, putative  24.6 
 
 
441 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2994  erythromycin esterase  24.43 
 
 
447 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3682  Erythromycin esterase  26.86 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192437  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1888  Erythromycin esterase  27.9 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0493647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2382  hypothetical protein  20.98 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2297  hypothetical protein  21.5 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2055  hypothetical protein  21.5 
 
 
443 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2052  hypothetical protein  22.07 
 
 
443 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3148  hypothetical protein  21.54 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.402784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5446  Erythromycin esterase  25.45 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2117  hypothetical protein  22.09 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1817  erythromycin esterase  28.09 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2112  Erythromycin esterase  28.25 
 
 
445 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4732  Erythromycin esterase  36 
 
 
313 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1781  Erythromycin esterase  22.67 
 
 
392 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0892  erythromycin esterase  24.55 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2712  Erythromycin esterase  23.32 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187447  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2420  erythromycin esterase  29.91 
 
 
537 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1168  Erythromycin esterase  28.12 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6177  Erythromycin esterase  32.48 
 
 
385 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>