18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3498 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3498  Erythromycin esterase  100 
 
 
374 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5057  Erythromycin esterase like protein  39.51 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.641423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0440  erythromycin esterase  42.42 
 
 
391 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1949  Erythromycin esterase  39.44 
 
 
417 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372413  hitchhiker  0.00455868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2112  Erythromycin esterase  37.6 
 
 
445 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1168  Erythromycin esterase  37.47 
 
 
390 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6177  Erythromycin esterase  35.25 
 
 
385 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2420  erythromycin esterase  34.86 
 
 
537 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2296  erythromycin esterase  37.38 
 
 
526 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1888  Erythromycin esterase  25.92 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0493647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1817  erythromycin esterase  28.83 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  29.39 
 
 
432 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4732  Erythromycin esterase  26.92 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2055  hypothetical protein  20.68 
 
 
443 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2297  hypothetical protein  20.68 
 
 
443 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2382  hypothetical protein  20.68 
 
 
443 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2117  hypothetical protein  20.34 
 
 
345 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  34.26 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>