More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4043 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
225 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  67.12 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  55.16 
 
 
218 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  53.68 
 
 
227 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  55.7 
 
 
230 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  50 
 
 
240 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  48.9 
 
 
216 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  47.64 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  48.28 
 
 
225 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  45.29 
 
 
212 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  45.61 
 
 
229 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  41.96 
 
 
254 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  46.22 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  43.44 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  43.11 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  41.13 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  45.87 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  40.23 
 
 
287 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  45.21 
 
 
218 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  41.78 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  42.44 
 
 
224 aa  131  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  43.33 
 
 
211 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  40.43 
 
 
223 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  42.61 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  43.12 
 
 
191 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  46.15 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  43.33 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  43.33 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  43.67 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  40.45 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  44.08 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  34.62 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  38.38 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  41.06 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  36.99 
 
 
248 aa  98.2  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  34.93 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  40.61 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  38.36 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  38.46 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  31.22 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  32.23 
 
 
236 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  38.33 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  38.67 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  37.1 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  32.24 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  34.78 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  34.91 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  31.7 
 
 
233 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  29.66 
 
 
239 aa  88.6  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  30.97 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  26.01 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  34.22 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  32.59 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  35.53 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  33.18 
 
 
233 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  40.69 
 
 
230 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  30.04 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  43.67 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  31.7 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  33.05 
 
 
241 aa  84.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  36.07 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  34.51 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  31.17 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  31.25 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  31.76 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  37.57 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  30.83 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  29.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  36.02 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  32.85 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  33.92 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  36.24 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  32.14 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.25 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  32.88 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  32.88 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  34.18 
 
 
891 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  32.88 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  31.25 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  35.75 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  30.8 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  32.43 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  36.2 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  33.47 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  35.75 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  31.7 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2898  peptidase M22 glycoprotease  45.04 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  36.09 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  31.53 
 
 
261 aa  79  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  35.75 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  31.53 
 
 
261 aa  79  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  34.51 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  31.74 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  35.24 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  29.15 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>