More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0734 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  74.8 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  70.49 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  67.48 
 
 		 135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  65.85 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  56.56 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  56.56 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  59.35 
 
 		 167 aa  147  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  57.63 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  55.93 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  50.41 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  55.83 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  55.83 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  55.83 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  57.38 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  58.68 
 
 		 134 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  57.72 
 
 		 135 aa  139  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  52.14 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  56.1 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  53.72 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  52.85 
 
 		 154 aa  137  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  55.28 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  54.1 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  48.36 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  52.94 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  57.38 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  52.03 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  53.39 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  52.1 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  57.55 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  48.33 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  48.78 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  48.78 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  47.15 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  47.41 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  45.45 
 
 		 134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  37.9 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  38.52 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  36.07 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  38.46 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  34.43 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  27.05 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.23 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  31.09 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  29.27 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.79 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  32.23 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  27.87 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.15 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  35.58 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  34.31 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  26.61 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  35.58 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  30.89 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  32.77 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  35.29 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  34.31 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  29.51 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  28.1 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  29.51 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  33.9 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  27.87 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  34.31 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  27.87 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  32.69 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  34.31 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.03 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  28.8 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  28 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.41 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  25.81 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  32.17 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  28.33 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>