53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0060 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  71.59 
 
 		 268 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  58.24 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  58.24 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  58.24 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  54.2 
 
 		 272 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  37.84 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  35.41 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  35.41 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  35.02 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  36.29 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  35.38 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  30.63 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  34.39 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  33.46 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  28.84 
 
 		 258 aa  85.5  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  30.45 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  29.62 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  26.27 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  25.1 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  26.14 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  27.31 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  27.31 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  28.34 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  27.31 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  23.62 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  27.76 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  26.16 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  27.27 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  25.54 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  26.05 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  25.59 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  25.19 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  28.74 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  25.68 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  27.44 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  28.85 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  28.07 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  22.73 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  25.65 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  20.62 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  28.99 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  26.95 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  22.22 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  26.38 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  27.06 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  28.45 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  20.62 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  24.1 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>