More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3739 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  63.04 
 
 		 212 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  63.04 
 
 		 212 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  65.93 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  66.3 
 
 		 234 aa  260  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 292 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 242 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 292 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  64.36 
 
 		 212 aa  256  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  61.96 
 
 		 258 aa  256  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 292 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 292 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 292 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 209 aa  254  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  60.87 
 
 		 209 aa  254  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  63.74 
 
 		 190 aa  254  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 211 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 211 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  63.78 
 
 		 211 aa  253  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  60.54 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  60.54 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 		 203 aa  251  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 		 203 aa  249  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  61.75 
 
 		 204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  60.33 
 
 		 206 aa  242  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  64.41 
 
 		 206 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  62.57 
 
 		 197 aa  241  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  62.78 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 205 aa  237  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  62.57 
 
 		 192 aa  235  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  64.57 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 222 aa  234  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  59.14 
 
 		 213 aa  231  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  56.76 
 
 		 206 aa  230  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 		 272 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  56.08 
 
 		 269 aa  228  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 213 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  55.91 
 
 		 219 aa  223  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 219 aa  223  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  55.08 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  54.26 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  59.04 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  53.44 
 
 		 234 aa  220  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 232 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 229 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  52.94 
 
 		 242 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  51.85 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  51.87 
 
 		 234 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 		 201 aa  210  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  51.1 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 204 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  53.51 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  51.87 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  52.08 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  52.94 
 
 		 219 aa  198  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 247 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.71 
 
 		 226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  55.25 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 		 216 aa  197  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 235 aa  194  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  49.47 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  52.54 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 189 aa  191  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  52.84 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 		 218 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>