91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2544 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  315  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  183  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  60.28 
 
 
161 aa  180  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  59.49 
 
 
158 aa  172  2e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  56.08 
 
 
157 aa  150  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  44.87 
 
 
164 aa  131  4e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  42 
 
 
168 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  40.62 
 
 
136 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  39.22 
 
 
166 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  35.71 
 
 
162 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  40 
 
 
176 aa  97.1  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  36.5 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  40.17 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  37.14 
 
 
177 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  38.28 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  39.06 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  39.06 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  39.06 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  39.06 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  33.91 
 
 
179 aa  83.2  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  40.14 
 
 
176 aa  83.2  1e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  34.34 
 
 
177 aa  83.2  1e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  37.59 
 
 
176 aa  83.2  1e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  39.04 
 
 
176 aa  82.8  2e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  39.04 
 
 
176 aa  82.8  2e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  37.59 
 
 
176 aa  82.8  2e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  36.72 
 
 
138 aa  82  3e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  81.3  5e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  36.72 
 
 
138 aa  80.9  6e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  33.12 
 
 
184 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  37.16 
 
 
178 aa  78.6  3e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  33.59 
 
 
138 aa  77  1e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  33.59 
 
 
138 aa  77  1e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  77  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  36.05 
 
 
179 aa  75.5  2e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  33.09 
 
 
178 aa  75.1  3e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  35.62 
 
 
187 aa  73.9  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  33.57 
 
 
173 aa  72.8  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  35.33 
 
 
183 aa  72.4  2e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  38.69 
 
 
140 aa  72.4  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  30.28 
 
 
147 aa  72.8  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  36.49 
 
 
181 aa  72.8  2e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  34.06 
 
 
146 aa  72  3e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  32.72 
 
 
181 aa  72  3e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  8e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  8e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  8e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  8e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  8e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  8e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  32.35 
 
 
175 aa  69.7  1e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  32.61 
 
 
146 aa  70.1  1e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  68.9  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  29.63 
 
 
177 aa  67.8  6e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  34.56 
 
 
177 aa  67.8  6e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  34.11 
 
 
167 aa  66.6  1e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  27.44 
 
 
174 aa  66.6  1e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  33.98 
 
 
176 aa  64.7  5e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  33.09 
 
 
176 aa  64.3  6e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  26.62 
 
 
144 aa  63.5  9e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  28.35 
 
 
141 aa  63.5  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  29.63 
 
 
159 aa  61.2  5e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  60.5  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  27.01 
 
 
149 aa  58.2  4e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  27.86 
 
 
142 aa  56.2  2e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  33.58 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  26.47 
 
 
142 aa  56.2  2e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  33.93 
 
 
144 aa  55.5  3e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  31.68 
 
 
155 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  28.86 
 
 
185 aa  53.5  1e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  33.09 
 
 
183 aa  52.4  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  29.55 
 
 
158 aa  52  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  29.79 
 
 
177 aa  52.4  3e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  31.19 
 
 
178 aa  50.4  9e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  27.94 
 
 
143 aa  50.1  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  27.66 
 
 
177 aa  49.7  2e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  26.12 
 
 
142 aa  49.3  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  24.75 
 
 
162 aa  48.1  5e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  24.75 
 
 
162 aa  48.1  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  24.75 
 
 
162 aa  48.1  5e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  26.05 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  26.96 
 
 
195 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  22.79 
 
 
153 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  24.41 
 
 
145 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  24.43 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  24.43 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  24.43 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>