24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7414 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  31.17 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  33.33 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  27.36 
 
 		 176 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  27.86 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  32.14 
 
 		 177 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  33.33 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  35.53 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  25.71 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  25.71 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  33.33 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.67 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  28.83 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  29.63 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  29.63 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  32.89 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  32.89 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  32.53 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  25.93 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  29.63 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  27.52 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  31.08 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  25.69 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>