70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1841 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
144 aa  296  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  41.67 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  37.86 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  35.66 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  39.86 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  37.14 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  35.46 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  35.46 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  35.46 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  35.46 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  35.46 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  34.75 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  34.75 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1923  hypothetical protein  35.38 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  34.97 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  34.97 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  34.27 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  33.08 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  33.08 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  32.59 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  29.2 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  33.82 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  32.09 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  31.25 
 
 
176 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  31.78 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  30.14 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  31.97 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  29.37 
 
 
175 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  33.11 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  32.33 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  26.67 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  31.34 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  25.6 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  26.92 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  26.92 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  26.92 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  31.58 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  29.93 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  32.67 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  27.78 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  28 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  28.77 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  33.04 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  30.34 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  33.04 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  32.14 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  27.07 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  27.03 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  27.97 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  29.63 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  28.77 
 
 
173 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  28.95 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>