77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  274  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  42.11 
 
 
136 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  40.46 
 
 
138 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  40.46 
 
 
138 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  39.69 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  38.35 
 
 
138 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  38.35 
 
 
138 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  36.09 
 
 
138 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  36.09 
 
 
138 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  36.09 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  39.69 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  36.09 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  37.88 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.35 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  31.69 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  31.82 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  33.59 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  33.88 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  29.17 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  31.25 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  29.29 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  36.92 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  26.92 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  27.81 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  35.43 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  36.15 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  32.89 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  32.09 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  31.85 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  32.89 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  33.81 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  30.28 
 
 
173 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  29.53 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  30 
 
 
184 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  32.21 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  32.21 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  28.86 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  33.58 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2087  hypothetical protein  26.67 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0822276  hitchhiker  0.00000491684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  31.54 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  30.71 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  29.13 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  23.49 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  30.85 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.17 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  29.14 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  25.5 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  25.5 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  28.29 
 
 
183 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  25.33 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  28.91 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  34.48 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  26.62 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  27.74 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  27.86 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  30.61 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  28.3 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  24.59 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  31.3 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  23.81 
 
 
158 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  24.16 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  27.93 
 
 
135 aa  40  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  25.6 
 
 
147 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>