38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0713 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  5e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  26.81 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  28.26 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  30 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  31.31 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  26.81 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  24.83 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  27.81 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  24.83 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  30.17 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  26.67 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  22.7 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  27.41 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  25.87 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  27.41 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  25.76 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  25.76 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  28.86 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  28.66 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  26.76 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  23.94 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  26.06 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  28.75 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  29.2 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  22.56 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  26.49 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  28.19 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  22.79 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  25.19 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  28.75 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  24.59 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0772  hypothetical protein  23.08 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000821647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>