63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1917 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  55.62 
 
 		 184 aa  193  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  56.29 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  53.85 
 
 		 176 aa  184  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  53.85 
 
 		 176 aa  183  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  50.64 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  55.48 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  46.47 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  46.84 
 
 		 173 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  42.94 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  43.53 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  43.02 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  40.96 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  43.75 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  42.94 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  42.21 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  39.08 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  41.03 
 
 		 179 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  39.24 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  39.74 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  44.71 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  38.46 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  38.46 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  40.76 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  35.15 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  33.9 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  35.06 
 
 		 177 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  37.66 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  34.16 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  32.64 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  29.56 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  31.21 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  28.31 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  30.59 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  34.59 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  31.88 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.84 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  31.98 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  29.5 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  27.91 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  31.51 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  31.51 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  31.51 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  32.08 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  28.26 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  24.83 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  28.99 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  27.54 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  27.54 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  27.54 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  27.54 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  26.81 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  26.81 
 
 		 138 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  26.09 
 
 		 138 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  30.71 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  24.32 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  24.32 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  26.03 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>